В 1680-87 годах в Богоявленском монастыре находилась школа братьев Лихудов, которая в дальнейшем, после перевода её в Заиконоспасский монастырь, была преобразована в Славяно-греко-латинскую академию.
Богоявленский монастырь на плане Москвы 1739 года:
- Монастыри:
3 — Богоявленский; 4 — Спасский; 5 — Никольский Греческий; 6 — Знаменский.
- В Китае:
30 — собор Казанской Божьей Матери; 31 — Покровский (Василия Блаженного); 32 — Заиконоспасский, с училищем, мужской монастырь; 33 — Никольский Греческий мужской монастырь; 34 — Богоявленский; 35 — Знаменский; 36 — Живоначальныя Троицы в Полях; 37 — Владимирской Божьей Материей; 38 — Иоанна Богослова, что под вязом; 39 — Николая Чудотворца Большой Крест; 40 — Козьмы и Дамиана, что в Панеж; 41 — Успения Богородицы, что в Рыбном ряду; 42 — Николая Чудотворца Красный Звон; 43 — Ипатия Чудотворца; 44 — Грузинской Божьей Матери; 45 — Иоанна Предтечи у Варварских ворот; 46 — Георгия Победоносца, что на Горке; 47 — Максима Исповедника; 48 — Великомученицы Варвары; 49 — Николая Чудотворца у Москворецких ворот; 50 — Николая Чудотворца Мокрого; 51 — Зачатия Святые Анны, что в Углу; 52 — Часовня Николаевского Песношского монастыря; 53 — подворье Боровского монастыря; 54 — Воскресенского монастыря; 55 — Новгородского; 56 — Калязинского; 57 — Покровского; 58 — Казанского; 59 — Троицкого; 60 — Иосифова; 61 — Вознесенского; 62 — Губернское правление с палатами и прочими судами; 63 — дом для Градской Думы, Магистрата и Аукциона; 64 — Духовная типография; 65 — Печатный двор, принадлежащий Духовной типографии; 66 — Ремесленная управа; 67 — Съезжий Частный дом; 68 — прежде бывший Частный дом; 69 — дом Человеколюбивого общества; 70 — Новый Гостиный двор; 71 — Старый Гостиный двор; 72 — Мытный двор; 73 — Рыбный двор; 74 — торговые лавки; 75 — Живорыбный ряд; 76 — хлебные магазины и лабазы; 77 — монумент гражданину Минину и князю Пожарскому; 78 — Лобное место; 79 — Воскресенские ворота; 80 — Никольские; 81 — Ильинские; 82 — Варварские; 83 — Москворецкие.
Богоявленский монастырь на плане Москвы 1888 года:
После Октябрьской революции монастырь был упразднен, и большинство его построек было разрушено.
До настоящего времени дошли собор Богоявления (1624-96) и здание братских келий (XVII век).
Сейчас собор Богоявления возвращен верующим. Ведется его ресставрация и восстановление.